A secretaria da CG cuida da organização das pautas e atas das reuniões, do encaminhamento das decisões tomadas pela comissão junto aos Departamentos, Diretoria e Pró-Reitoria de Graduação, bem como do controle dos recursos orçamentários advindos dos Programas da Pró-G (Pró-Eve, Pró-Lab, Pró-Int) e também dos Programas de Bolsas como Ensinar com Pesquisa e de Estímulo ao Ensino de Graduação – PEEG, acompanhando e adequando os documentos expedidos às normas e à legislação pertinente estabelecidas pelos órgãos superiores.